Arctic Fish Merge fonctionne sur un système de fusion basé sur une grille où des poissons gelés identiques se combinent pour créer des espèces évoluées. En commençant par du krill et du plancton de base au niveau 1, les joueurs font glisser les poissons correspondants les uns sur les autres pour débloquer progressivement des créatures arctiques plus grandes. Chaque fusion réussie génère des cristaux de glace, la monnaie principale utilisée pour acheter de nouveaux générateurs de poissons et débloquer des zones océaniques plus profondes.
Le jeu met en œuvre un moteur de progression incrémentale avec 50 espèces de poissons distinctes réparties sur 10 niveaux évolutifs. Les poissons de niveau supérieur comme les narvals, les orques et les baleines glaciaires légendaires génèrent exponentiellement plus de cristaux de glace par seconde. La grille de fusion s'étend de 4x4 à 8x8 au fur et à mesure que vous débloquez de nouveaux biomes, chaque zone introduisant des mécaniques de température qui affectent les taux d'apparition et les bonus de fusion.
Des générateurs de poissons automatisés apparaissent toutes les 15 secondes, déposant des espèces aléatoires sur les espaces de grille disponibles. Le placement stratégique est essentiel car la fusion de trois poissons identiques simultanément déclenche un multiplicateur de combo, augmentant la production de cristaux de glace de 200 % pendant 30 secondes. L'écosystème glaciaire réagit à vos fusions : compléter des chaînes de poissons spécifiques débloque des événements environnementaux comme des boosts d'aurores boréales et des défis de dérive d'icebergs qui augmentent temporairement la fréquence d'apparition.